Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms