Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms