Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNPO2Q9UMS6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNPO2Q9UMS6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms