Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms