Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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