Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms