Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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