Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms