Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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