Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4BQ8N7F7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms