Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms