Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AL078590.3-201ENST00000607531 750 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 KIR2DL4-201ENST00000345540 1447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC012572.1-201ENST00000581634 397 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MIR3194-201ENST00000582236 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TIPRL-201ENST00000367830 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP350Q5VT06 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms