Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms