Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTCH1Q13635 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTCH1Q13635 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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