Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF1Q12946 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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