Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms