Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBE1Q04446 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBE1Q04446 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBE1Q04446 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBE1Q04446 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GBE1Q04446 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBE1Q04446 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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