Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms