Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NESP48681 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NESP48681 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NESP48681 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NESP48681 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NESP48681 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms