Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms