Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms