Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms