Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms