Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GM2AP17900 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms