Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms