Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTMAP06454 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms