Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACSL4O60488 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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