Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms