Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms