Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms