Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms