Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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