Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TCF23Q7RTU1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms