Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MICAL3Q7RTP6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MICAL3Q7RTP6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms