Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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