Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms