Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms