Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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