Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PTPRR-201ENST00000283228 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MAGEC3-201ENST00000298296 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms