Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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