Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms