Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1BQ00975 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1BQ00975 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms