Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms