Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA1P78396 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms