Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSCP56915 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSCP56915 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GSCP56915 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms