Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms