Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms