Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRMP28827 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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