Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 TRIM64FP-201ENST00000427305 1371 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AMTN-201ENST00000339336 1037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXB1P14653 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXB1P14653 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXB1P14653 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXB1P14653 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXB1P14653 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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