Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms